Bakuman berkisah tentang sepak terjang sepasang pemuda, Mashiro Moritaka (a.k.a. Saiko) dan Akito Takagi (a.k.a. Shuujin), dalam menggeluti profesi sebagai mangaka. Kisah Bakuman dimulai ketika keduanya duduk di bangku kelas 3 SMP. Shuujin adalah pelajar teladan yang punya cita-cita nyeleneh: menjadi mangaka. Karena tidak bisa menggambar, dia pun membujuk Saiko untuk menuangkan ide-idenya ke dalam bentuk manga. Tentu saja Saiko tidak menerima ajakan Shuujin begitu saja. Lantaran Saiko sendiri punya kenangan sentimental tentang dunia manga : Pamannya, Taro Kawaguchi, adalah idola masa kecil Saiko; seorang mangaka kawakan yang kemudian meninggal karena bekerja terlalu keras.