Anime ini bercerita tentang Kyotaro Kakei, yang merupakan satu-satunya anggota klub perpustakaan di Akademi Shiomi. Satu hari ia menerima email dari ‘The Shepherd’ yang mengaku bisa mengabulkan permintaan. Dikatakan bahwa “Kamu akan mengalami sebuah kejadian yang akan merubah hidupmu”. Setelah pertemuan dengan seorang murid bernama Tsugumi Shirasaki, anggota harem bergabung satu demi satu ke dalam klubnya.